O Museu da Cidade ocupa as instalações do antigo Hospital San Juan de Dios, o edifício civil mais antigo de Quito, uma instituição que funcionou por mais de 400 anos, de 1565 a 1974, como espaço hospitalar e de recepção. Uma das exposições permanentes oferece uma viagem através dos costumes, pessoas e tradições de Quito, através da sua história exibida do século XVI ao século XIX.